Bueno, resulta que has instalado una distro de linux junto a tu windows y ahora quieres quitarlo ¿no?
Si eliminas la partición de linux te va a dejar el grub por ahí danzando y dando fallos, por lo que no te dejará iniciar.
¿Qué hacer? Cogemos una live e instalamos lilo. ¿Lilo? ¡Pero si eso es del año de la tana! Pues sí, luego con el comando
"lilo -M /dev/sda mbr"
Lo reparamos y listo, a cargar windows!